OK, ich habe das Problem anscheinend gelöst. Ich sage anscheinend, weil ich noch ein etwas merkwürdiges Verhalten des Dateimanagers hatte, das sich aber nicht reproduzieren ließ. Muss ich noch mal beobachten. Ich kann aber nur sagen, was das Problem gelöst hat, das warum kann ich gar nicht nachvollziehen.
Ich hatte im Forum noch mal die Threads durchsucht und dabei war bei verschwundenen Files auf dem Desktop geraten worden, mal den dconf-editor laufen zu lassen und unter
dconf-editor → org → gnome → desktop → background → show-desktop-icons
zu schauen, ob der Haken gesetzt ist. Der war bei mir gesetzt. Aber Haken abwählen, wieder setzen und beenden hat das Problem mit dem Desktop und mit dem Einfrieren beim Minimieren von Fenstern gelöst. Ist schon etwas merkwürdig, denn auch das Problem mit dem Desktop waren ja nicht nur die fehlenden Dateien, sondern auch, dass kein Hintergrund gewählt und kein Kontext-Menu für den Desktop aufgerufen werden konnte.
Die Standard-Schriftarten unter Unity hat die Installation des Gnome-Desktops übrigens ebenfalls überschrieben. Sah fürchterlich aus. Ich habe im Unity Tweak Tool die scheußliche Standard-Schrift durch die entsprechenden Ubuntu-Fonts ersetzt. Jetzt scheint mir wieder alles normal.
Solange mir nichts weiteres auffällt, lasse ich Gnome dann wohl einfach in Ruhe. Ist mir zu heikel das Paket nach der folgenden Anleitung zu deinstallieren.
https://askubuntu.com/questions/767577/how-can-i-remove-gnome-desktop-environment-without-messing-unity-de-ubuntu-16