Moment - wenn du 12.04 behalten willst, dann sicher das komplett und sieh meine Erklärung nur als ergänzendes Wissen an. Einen Grund zur Neuinstallation sehe ich nicht.
Außer, weil du nach dem Sichern, Partitionstabelle frisch Anlegen, Partitionieren, Formatieren und Backup-Rückspielen noch die UUIDs der fstab aktualisieren und Grub neu installieren müsstest - außer du sicherst in ein dickes Image per z.B. Clonezilla oder dd. Braucht aber viel Platz und je nach Durchführung auch eine Neuinstallation von Grub.
Also alles aufwendiger bzw. mehr zu lernen als bei einer Neuinstallation mit gesichertem Home.
Edit: Dafür bitte ein neues Thema - für fernzusteuernde Linuxrechner eignet sich VNC besser - habe dazu eine Anleitung auf meiner Benutzerseite.