Moinsen,
gscan2pdf ist in erster Linie ja dafür da, aus eingescannten Dokumenten PDF-Dateien zu erzeugen.
Für OCR gibts da besseres, bitte mal im Wiki unter dem Suchbegriff OCR nachlesen.
YAGF und Tesseract sind da auch gute Suchbegriffe, dürfte aber alles unter OCR im Wiki zu finden sein.
@Basel:
Das Problem, das Du hast, tritt verstärkt auf, wenn mit dem Scannertreiber etwas nicht ok ist oder aber der Scanner mit Linux nicht voll kompatibel ist. Es wäre daher hilfreich, wenn Du mal berichten würdest, was genau für einen Scanner Du hast und mit welchen Treiber Du ihn betreibst.
Grüße, T.