Also ich habe nur Gnome, aber das Prinzip sollte das gleiche sein.
Zuerst muss du bei Sprachen "Japanisch" hinzufügen.
Dann solltest du eigentlich, wenn der Cursor z.B. in einem Firefox- Fenster steht, die japanische Eingabe schon aktivieren können. (Strg + Space)
(Wenn der Cursor nicht in einem Eingabefeld blinkt, kannst du nicht umschalten)
Soweit scheinst du ja schon zu sein, wenn du in der Scim-Leiste "nippon" angezeigt bekommst.
Jetzt solltest du statt "nippon" "Anthy" auswählen. (Wird mit einer kleinen Krone angezeigt).
Wenn du Anthy nicht findest: Über synaptic Paketverwaltung nachinstallieren. Sollte aber eigentlich mit der Installation von "Japanisch" schon erledigt sein...
Mit Anthy funktioniert die Eingabe eigentlich genau wie unter Windows IME, wenn du in der Scim-Leiste あ und 連 stehen hast.
also z.B. einfach "toukyou" tippen, erscheint als とうきょう, dann mit Space durch die möglichen Kanjikombinationen blättern und bei der Gewünschten "Enter" drücken. –> 東京